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剧情回顾：你在亚马逊的波利斯遗迹里，触动了第一颗水晶的力量，水晶与你身上的古籍发生反应，你被传送到了古时候的埃及。凭着你超人的智慧与力量，帮助马赛尤斯打败塞克奥特的军队，登上了法老王的王座，并结束了尼罗河流域长期分裂的局面。
作为对你的答谢，马赛尤斯送给你一个包裹，并告诉你曾经有个人要他转告你得到里面的东西以后，去帮助你第一眼看见的人。让你没想到的是，包裹里是一堆闪烁发光的水晶，水晶又与你身上的古籍产生共鸣，导致古籍释放出巨大的光芒，笼罩了你。一阵眩晕之后，当你再次睁眼时，你发现自己又来到了一个完全陌生的环境……
回到秦末
这一次你被古籍带到了秦末农民战争的时期，遭遇了刘邦。帮助他解决了一系列的事件。你们一起进入皇陵进行修缮工作，却意外发现始皇的军人根本就没打算让你们活着离开。你前往主墓室通知刘邦尽快逃离，他却为一块墓室中的水晶着迷。不得已的情况下，你同他发生了争执。不料刘邦使用借水晶之力蜕变的宝剑挡住了你的攻击，水晶的力量与你身上的古籍再次产生共振，撕裂了时空。你又被送到陷入垓下之围的项羽身边。你冒充流民在楚军军营里见证了西楚霸王最后的时光。从他口中得知了一些关于水晶的线索。为了回到原来的世界，你决定前往郦山皇陵，再次搜寻水晶的痕迹……
后秦陵探寻第三颗水晶之谜
为了解开水晶之谜，回到现实中的世界，你决定再次进入秦始皇陵，寻找刘邦。在骊山，你经过邛德斯的指引，根据盗墓者的路标，找到一条进入秦陵的密道。在陵墓中的墙壁上得到关于进入陵墓主墓穴的提示，需要收集“兑离震”开启“乾之门”， 收集“艮坎巽”开启开坤门。
再遇刘邦
你将收集来的“兑离震”和“艮坎巽”嵌入陵墓墙壁上的凹痕，随着一声巨响，门上无形的阻力突然烟消云散，这时，你看到主墓穴内站在始皇棺木前的刘邦，他正一手持剑，一手握着水晶站在始皇帝的棺前，你决定上前询问有关神秘水晶的事情。