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强台莫兰蒂在全台发威，被视为世界最大的活体珊瑚群“绿岛大香菇”，也在莫兰蒂台风造成的巨浪侵袭下倒塌，台东飞鱼潜水教练俞明宏在个人脸书心痛表示，这是台湾人民的损失，也希望人可以前来协助，清除大香菇上增生的藻类与碎块。
东部海岸国家风景区管理处今年首度举办东海岸大地艺术节系列活动“2016月光.海音乐季”活动，但受到强台莫兰蒂影响，原订9月16、17日举办的“摇摆之夜”、“吟唱之夜”，受到强台莫兰蒂及马勒卡影响取消，活动专车及月光美食竞赛亦取消。
莫兰蒂台风袭卷金门，17级阵风导致多数树木倒塌，部分景点也有受到台风损害，甚至交通部分也尚未完全恢复，《ETtoday东森新闻云》特别整理目前金门交通及景点关闭状况，分别如下：